海关以经过审核的单证为依据，在海关监管场所(包括口岸码头、车站、机场、邮局等)对所申报的进口货物进行检查，以核对单物是否相符。海关查验时，报关人应派人到现场协助海关工作。
进口货物的收货人或其代理人收到海关的税款缴纳证书后，应在规定的期限内缴纳进口税款。我国《海关法》对进口货物纳税期限的规定与出口货物的相同。进口货物以海关审定的正常CIF价格为完税价格。CIF价格不能确定时，完税价格由海关估定。
计算进口关税税款的基本公式是：进口关税税额=完税价格×关税税率
进口清关流程
1.进口换单——去货代或船公司换签D/O。（根据手中提单来确定是到何处换单。H B/L货代提单 M B/L船东提单）
2.海关电子申报——电脑预录、审单、发送、与海关联系/放行。
3.报检（三检）——电子申报放行后，凭报关单四联中的一联去商检局办理报价手续，出通关单或敲三检章。
4.报关——递交纸质资料（2014年11月1日起 [1] ，对企业资质有一定的要求）
5.交税——海关审价按照货物对应编码下税率征税
6.查验（如海关认为有必要）——海关根据货物申报品名的监管条件，与当日查验概率给予查验，如有查验会开出查验通知书
7.放行——海关放行有以下几个步骤：1.一次放行2.开出查验通知书或无查验直接2.次放行3.查验后，做关封后放行。
8.提货——放行后，收货人可提取货物至自有仓库、销售等
查验：税金交纳后等待海关的进一步指示。海关如需查验货物，则由报关员和海关官员共同查验，查验合格后，货物方可放行。送货：根据进口商的要求，货运代理可派车将货物送至指定地点。成本核算：在此票货物顺利清关并抵达进口商指定地点后，进行后期成本核算。货运代理进口报关发生的费用如下：运输费、报关费、代垫税金、操作费、仓储费等。
此外，进口商应注意货物的申报期。海关规定，进口货物应自运输工具进境之日起l4日内办理申报。如逾期申报，海关则自第l5日起按到岸价每日征收0．05%的滞报金。如超过3个月仍未申报，海关即变卖货物，在扣除各种费用后，余款上缴国库。