进料加工贸易的进口，其大体的程序差不多。不同的是要先办手册。（关于手册的办理有空再另辟主题）分为进料加工手册和来料加工手册。报关的时候要用加工贸易的手册，再加上一般贸易几口所需的资料进行报关。
再就是缴关税，因为有手册，所以如果你进口的货物是免税的，只缴保证金，有的是需要缴全额的也就是的保证金，有的只缴100元的保证金。这些保证金等你的手册上面的所有进口料件核出口成品都出完了，那就要核销，核销完了你缴的保证金会一分不少的退回给你。和一般贸易所交的关税的操作程序一样。只不过一个是关税，一个是保证金。
海关接受申报的方式一般有3种：口头申报、书面申报及电子数据交换申报，其中以后两种申报形式为主。
按照我国《海关法》的规定，进口货物的申报期限为自运输工具进境之日起14日内，超过14日期限未向海关申报的，由海关按日征收进口货物CIF(或CIP)价格的0．5‰的滞报金。超过3个月未向海关申报的，除有特殊原因的以外，由海关将货物提取变卖，所得价款在扣除运输、装卸、储存等费用和税款后尚有余款的，自货物变卖之日起1年内，经收货人申请，予以发还；逾期无人申请的，上缴国库。 申报的具体手续是：进口货物到货后，申报人根据进口单据填写进口货物报关单向海关申报。
操作流程：
物流公司收到货以后，会安排空运到香港，然后从香港，包税包清关到中国大陆，如保健 品，化妆品，奶粉，红酒，保健食品等 等，都可以采用这种方式，包税包清关的，到你手上没有别的税费之类的了。有保障。
优势：
1、无需单证，解决了单证问题。
2、以快件样品包税清关，无需检验检疫环节，省钱省时间。
3、价格优势，比一般贸易进口少了增值税，关税，优势明显。
4、时效快，7-10天就进口回来了，周转快，时间就是金钱。
接货：进口商或国外公司以电话或传真通知进口部人员货物即将入关，操作人员派车到进口商处提取清关文件。委托人应当向货运代理提供所委托报关事项的真实情况。
报关：报关员在接到清关文件后先行审核，审核无误后交由海关进行清关。
出税：在海关审核无误后，将会自动打出一份进口关税税单和增值税税单，由客户直接交纳税金，或由货运代理代垫税金。进口转关货物，按货物运抵指运地海关之日的汇率和税率征税。