承包水利工程施工项目的企业必须是施工企业，主要类型包含水利水电施工总承包及河湖整治、水利水电机械设备安装等资质，总承包分特级、一级、二级、三级，可承包水利工程大小及投资规模由大到小；专业承包分一级、二级:从事水利工程的资格证是属个人所拥有，个人拥有其种资格证书，只能从事某项具体的工作，不能承包工程。
提交申请：办理资质的公司应以法定代表人为名向县区基本建设行政主管部门明确提出申请书，县区基本建设行政主管部门允许后，提交市房屋和城乡建设局。
二级资质标准 企业主要人员 （1）水利水电工程专业注册建造师不少于15人，其中一级注册建造师不少于6人。 （2）技术负责人具有8年以上从事工程施工技术管理工作经历，且具有水利水电工程相关专业高级职称或水利水电工程专业一级注册建造师执业资格；水利水电工程相关专业中级以上职称人员不少于30人。 （3）持有岗位证书的施工现场管理人员不少于30人，且施工员、质量员、员、材料员、资料员等人员齐全。 （4）经考核或培训合格的中级工以上技术工人不少于40人。
一级资质标准 企业主要人员 （1）水利水电工程专业一级注册建造师不少于15人。 （2）技术负责人具有10年以上从事工程施工技术管理工作经历，且具有水利水电工程相关专业高级职称；水利水电工程相关专业中级以上职称人员不少于60人。 （3）持有岗位证书的施工现场管理人员不少于50人，且施工员、质量员、员、材料员、资料员等人员齐全。 （4）经考核或培训合格的中级工以上技术工人不少于70人。