在进行工业洁净厂房的平面设计之前，应充分考虑各项工艺流程是否需会产生可燃性气体、可燃性粉尘、纤维，并计算其浓度高低等。从而确定洁净厂房内是否需要设置防爆区并计算防爆区的面积。
通常情况下工业洁净厂房的平面布局、管线布置、功能分区、室内装修等均会在土建工程完成之后进行二次设计。但由于防爆区对承重结构和泄压设施的特殊要求（防爆墙、防爆区结构类型、防爆区与非防爆区的联通、防爆区泄压面方向及面积等），这部分内容应在初次设计时就应当考虑在内，这主要是出于以下几个方面考虑。
通常情况下工业洁净厂房内仅有部分工艺需要设置在防爆区，而防爆区与非防爆区之间应设置抗爆墙。在抗爆墙中，不可以预留通风孔，也尽量不要设计门窗结构。如果在实际使用过程中有特殊需求需要设置门窗时，应当使用具有抗爆功能的门窗且防爆墙不宜作为承重墙。
在确定面积时还有一点值得注意的是，防爆区与非防爆区的区别之一就是不需要设置回风设备及管道，仅需设置排风、排烟、除尘与送风设备及管道，且防爆区排风管道不与其他区域排风管道相连，防爆区需单独设置防爆型排风风机箱。