早在 2006 年北京协和医院在国内率先设立痛风专科门诊，曾学军教授曾先后组织并参与多个降尿酸的上市前后研究。课题组是国内蕞早开展规范化关节穿刺核实临床诊断痛风的团队，多次获得行业基金等项目支持开展高尿酸血症和痛风的相关研究，开展流行病学、医生诊疗行为医学、疾病治 疗规范制订与推广、以及卫生经济学等研究。
曾学军教授参与了国内目前所有关于痛风和高尿酸血症指南的制定工作， 2013 年牵头制定了《高尿酸血症社区管理规范草案》，2018年11月在中华全科医师杂志上发表修订版《高尿酸血症社区管理流程的专家建议》，2020年4月再次牵头制定《痛风及高尿酸血症基层诊疗指南》。
北京协和医院风湿免疫科为了促进中国风湿病的普及与提高，自建科以来，坚持每年举办形式多样的风湿病学讲习班和学术会议，编著多部风湿病学专著，同时结合风湿病学临床的需要开展科学研究，取得了极大的成绩，是国家教委风湿病学博士学位授予点、风湿免疫内科博士后流动站、国家教委风湿病学重点学科单位、卫生部住院医师培训基地、风湿免疫科专科继续教育基地、风湿临床试验基地、教育部重点实验室，风湿病学博士生/博士后培养单位，为全国培养了大量风湿病学的专业人才。
重视科研是协和风湿免疫科的传统。科室1979年起就率先在全国进行自身抗体检测的研究。1988年，“抗核抗体谱的建立及临床应用研究”获国家科技进步三等奖；1995年，“原发性干燥综合征的系列研究”获国家科技进步三等奖；近年来，获北京市科学技术奖、中华医学科技奖、华夏医学科技奖等省部级奖项共计13项。