北医三院拥有3个教育部创新团队：骨科、运动医学研究所、妇产科；3个教育部重点实验室：辅助生殖、分子心血管学（参与）和视觉损伤与修复（参与）；1个国家卫生健康委重点实验室：心血管分子生物学与调节肽；8个北京市重点实验室：磁共振成像设备与技术、脊柱疾病研究、生殖内分泌与辅助生殖技术、心血管受体研究、运动医学关节伤病、幽门螺杆菌感染与上胃肠疾病、眼部神经损伤重建保护与康复、神经退行性疾病生物标志物研究及转化。
北医三院以强烈的社会责任感积极投身公立医院改革。近年来不断提高管理水平，参与多个重大项目和课题的研究，取得成果被政府相关管理部门所采纳。在临床路径、优质服务护理工程、对口支援、医联体建设、援藏援疆支边等方面发挥了医院的作用。同时，医院还承担着国家重大活动的医疗保障工作，承担着重大突发事件的医疗救援任务。近年来，出色完成了北京奥运会、建国六十典、抗震救灾、健康快车、埃博拉出血热病人救援、非洲“光明行”、历次全国“两会”等各项医疗保障任务。
北京成立多年医疗公司提供：北京大学第三医院加急检查挂号，北京大学第三医院加急住院挂号，北京大学第三医院跑腿代办挂号，服务每一位患者，帮助您在北京各大医院看病少走弯路不浪费时间和金钱。北京儿童医院，同仁医院 协和医院，天坛医院等等各大三甲医院均提供挂号，加急加急检查，快速住院。
陪诊师主要服务对象大部分是老年人，也包括省内周边地区来的患者，其中有不少人都对医院非常不熟悉。
患者的腿
从进入医院的那一刻起，我们为患者排队取号、送化验标本、取化验报告、安排B超CT、到药房拿药，免去患者的奔波劳累。
患者的嘴
我什么时候再来复查？我这个药该怎么吃？我这个化验结果有什么问题吗？进了医院，总是有各种问题要问医生，而医生却总是那么忙碌，没关系，我们懂的，会给患者专业的回答，不懂的，我们会替你咨询医生、药师、检验师。
患者的眼
入院后，病情有没有变化？中西药，发的药有没有遗漏？做检查，是不是忘记哪一项？这些，不用患者劳心，我们会替你看到。